沈阳医学院建校之初，分别设立免疫与微生物学教研室、人体寄生虫学教研室。2006年，根据国家教育部学科调整的精神，医学微生物学教研室、人体寄生虫学教研室合并组成病原生物学教研室。2013年，获教育部病原生物学硕士学位授予权。教研室曾获“沈阳市先进集体”、“沈阳市三八红旗集体”、“沈阳医学院特别贡献奖”等荣誉称号。教研室现有教职工17人，其中教授2人、副教授6人、讲师6人、实验师3人。具有博士学位者12人，硕士以上学历达100%。

病原生物学教研室主要承担《病原生物学》、《医学微生物学》、《微生物学》、《寄生虫学》、《微生物与微生物检验技术》等课程，其中省级一流课程3门、校级一流课程1门；校级普通本科教育课程思政示范课程1门。自2006年以来，本教研室根据留学生培养计划，扎实开展留学生病原生物学课程教学工作，实现跨文化交流，推动教育文化多样性，为教育创新注入了新的活力。除此之外，本教研室积极推行实验室开放政策，面向全校学生开展酸奶中益生菌检测、真菌棉兰染色等实验项目，促进学术交流、实现资源共享、加强人才培养，推动科技发展和社会进步。

教研室教学团队共主持教研项目17项，发表教学研究论文20篇。曾获得辽宁省教学成果奖、院级精品课程、“第二届全国高校（医学类）微课程”二等奖、“第十一届、第十二届沈阳医学院青年教师教学技能竞赛” 三等奖等奖项。主编或参编教材总计24部，有代表性的包括《病原生物学》、《医学微生物学》、《微生物学与免疫学》等。

教研室教师团队共主持科研项目39项，其中国家级2项、省级22项。发表科研论文125篇，其中SCI 63篇、核心期刊24篇。现有硕士研究生导师6人，研究方向主要为：（1）病原微生物感染等相关研究；（2）肿瘤致病机制、肿瘤免疫调控机制以及靶向药物筛选等相关研究；（3）肝炎病毒致病机制及抗病毒感染等相关研究。

本教研室教师团队指导大学生创新创业项目共46项，其中国家级4项，省级12项，校级30项；指导学生参赛曾获奖11项，其中国家级5项、省级3项、校级3项。